学校创办于1934年,时名湖南国医专科学校,1960年改办为普通高等本科院校湖南中医学院,1990年原湖南科技大学成建制并入湖南中医学院,2002年湖南省中医药研究院与湖南中医学院合并,2006年经教育部批准更名为湖南中医药大学。2012年学校进入一本招生序列。目前学校与湖南省中医药研究院实行校院合一的管理体制。
学校现有含浦、东塘2个校区,总占地面积1393亩,校舍建筑面积47万平方米。现有3所直属附属医院,12所非直属附属医院,5个校办合资企业。学校构建了以医学学科为主体,医、理、工、管、文等学科门类协调发展的学科体系。拥有中医学、中西医结合2个博士后科研流动站。现有一级学科博士学位授权点1个,二级学科博士学位授权点14个;一级学科硕士学位授权点4个,二级学科硕士学位授权点24个;获评6个二级学科自主设置博士学位授权点,14个二级学科自主设置硕士学位授权点。
我院继续教育始于1960年,1999年成立成人教育学院,2012年更名为继续教育学院。目前,成教在籍学生26814人,分本科与专科两个层次,分业余、函授两种形式。目前有中医学、临床医学、药学、中药学、口腔医学、医学影像学、医学检验技术、护理学、中西医临床医学、针灸推拿、康复治疗学等36个专业。继教教育学院共享学校的教学资源,
我院成人教育在教学管理、教材建设、教学方法等方面取得了一定成就,在国内有较大影响。曾多次被国家中医药管理局和湖南省教育厅评为成人教育先进单位。连续七年被湖南省教育考试院授予成人教育招生先进单位。目前学校与湖南省中医药研究院实行校院合一的管理体制。